将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！这时，纽约市中发生一连窜的怪事。原来实业家马克西米林安•J•威特斯意图征服纽约市，秘密培养了一支远古怪兽组成的军队，加上恶名昭彰的忍者组织Foot Clan，各种黑暗势力又在城市的角落里蠢蠢欲动！神龟们又处于备战状态了！他们再次联合起来，准备向黑暗势力出击！
演员：安娜·肯德里克 贾斯汀·汀布莱克 佐伊·丹斯切尔 克里斯托夫·梅兹-普莱瑟 克里斯汀·芭伦斯基 拉塞尔·布兰德 格温·斯蒂芬妮 约翰·克里斯 詹姆斯·柯登 杰弗里·塔伯 罗恩·芬奇斯 艾诺·贾沃 卡洛琳·耶尔特 昆瑙·内亚 奎文赞妮·瓦利斯 沃尔特·道恩 瑞斯·达比 瑞奇·狄龙 葛洛泽尔·格林 康达尔·约翰逊 格雷斯·赫尔比希 柯提斯·史东 迈克·米切尔
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演员：克里斯汀·贝尔 伊迪娜·门泽尔 乔什·加德 乔纳森·格罗夫 杰森·雷特 埃文·蕾切尔·伍德 斯特林·K·布朗 玛莎·普林顿 圣蒂诺·方塔纳 阿尔弗雷德·莫里纳 瑞秋·马休斯
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演员：大山羡代 小原乃梨子 野村道子 立壁和也 肝付兼太 桑岛法子 新山千春 小锦八十吉 千千松幸子 野泽雅子 杉山佳寿子 穗积隆信 藤田淑子 银河万丈 南央美
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